U5 snRNA

U5 snRNA
	U5の予測二次構造と配列保存性
識別
略称	U5
Rfam	RF00020
その他のデータ
リボ核酸の種類	遺伝子; snRNA; RNAスプライシング
ドメイン	真核生物
GO	0000351 0000353 0005682 0046540
SO	0000395
PDB構造	PDBe

U5 snRNA（U5 small nuclear RNA）は、スプライソソームの構成要素としてRNAスプライシングに関与するsnRNAである。いくつかのタンパク質を結合してU5 snRNPを形成するが、結合するタンパク質には、スプライソソームで最大かつ最も保存されたタンパク質であるPrp8、スプライソソームの活性化に必要なヘリカーゼであるBrr2（英語版）、Snu114（英語版）、7つのSmタンパク質（英語版）が含まれる^[1]。U5 snRNAは、スプライソソームの活性部位へ伸びる、同軸スタッキング（coaxial stacking）した一連のヘリックスからなる^[2]^[3]。ループ1は一連のヘリックスのキャップとなり、スプライシングの2つの化学反応の間、5'エクソンと4–5塩基の塩基対を形成する^[4]^[5]。この相互作用は、2段階目の反応であるエクソンのライゲーションの際に特に重要であるようである^[6]。

出典

^ “Biochemical and genetic analyses of the U5, U6, and U4/U6 x U5 small nuclear ribonucleoproteins from Saccharomyces cerevisiae”. RNA 7 (11): 1543–53. (November 2001). PMC 1370197. PMID 11720284.
^ “The architecture of the spliceosomal U4/U6.U5 tri-snRNP”. Nature 523 (7558): 47–52. (July 2015). doi:10.1038/nature14548. PMC 4536768. PMID 26106855.
^ “Structure of a yeast spliceosome at 3.6-angstrom resolution”. Science 349 (6253): 1182–91. (September 2015). doi:10.1126/science.aac7629. PMID 26292707.
^ “U5 snRNA interacts with exon sequences at 5' and 3' splice sites”. Cell 68 (4): 743–54. (February 1992). doi:10.1016/0092-8674(92)90149-7. PMID 1739979.
^ “The U5 and U6 small nuclear RNAs as active site components of the spliceosome”. Science 262 (5142): 1989–96. (December 1993). doi:10.1126/science.8266094. PMID 8266094.
^ “The invariant U5 snRNA loop 1 sequence is dispensable for the first catalytic step of pre-mRNA splicing in yeast”. Cell 86 (4): 679–89. (August 1996). doi:10.1016/s0092-8674(00)80140-3. PMID 8752221.

外部リンク

Rfam page for U5 spliceosomal RNA

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[1] “Biochemical and genetic analyses of the U5, U6, and U4/U6 x U5 small nuclear ribonucleoproteins from Saccharomyces cerevisiae”. RNA 7 (11): 1543–53. (November 2001). PMC 1370197. PMID 11720284.

[2] “The architecture of the spliceosomal U4/U6.U5 tri-snRNP”. Nature 523 (7558): 47–52. (July 2015). doi:10.1038/nature14548. PMC 4536768. PMID 26106855.

[3] “Structure of a yeast spliceosome at 3.6-angstrom resolution”. Science 349 (6253): 1182–91. (September 2015). doi:10.1126/science.aac7629. PMID 26292707.

[4] “U5 snRNA interacts with exon sequences at 5' and 3' splice sites”. Cell 68 (4): 743–54. (February 1992). doi:10.1016/0092-8674(92)90149-7. PMID 1739979.

[5] “The U5 and U6 small nuclear RNAs as active site components of the spliceosome”. Science 262 (5142): 1989–96. (December 1993). doi:10.1126/science.8266094. PMID 8266094.

[6] “The invariant U5 snRNA loop 1 sequence is dispensable for the first catalytic step of pre-mRNA splicing in yeast”. Cell 86 (4): 679–89. (August 1996). doi:10.1016/s0092-8674(00)80140-3. PMID 8752221.

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U5 snRNA

出典

関連文献

外部リンク