EED (タンパク質)

EED（embryonic ectoderm development）は、ヒトではEED遺伝子によってコードされているタンパク質である。

EED
PDBに登録されている構造 PDB オルソログ検索: RCSB PDBe PDBj PDBのIDコード一覧 3IIW, 3IIY, 3IJ0, 3IJ1, 3IJC, 3JPX, 3JZG, 3JZH, 3JZN, 3K26, 3K27, 4X3E, 5IJ7, 5IJ8, 5HYN
識別子
記号	EED, HWAIT1, embryonic ectoderm development, COGIS
外部ID	OMIM: 605984 MGI: 95286 HomoloGene: 2814 GeneCards: EED
遺伝子の位置 (ヒト) 染色体 11番染色体 (ヒト) バンド データ無し 開始点 86,244,753 bp 終点 86,278,813 bp
遺伝子の位置 (マウス) 染色体 7番染色体 (マウス) バンド データ無し 開始点 89,603,862 bp 終点 89,630,191 bp
RNA発現パターン さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 • クロマチン結合 • 血漿タンパク結合 • identical protein binding • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • histone methyltransferase activity • histone methyltransferase activity (H3-K27 specific) • nucleosome binding 細胞の構成要素 • sex chromatin • ESC/E(Z) complex • 染色体 • pronucleus • 細胞核 • 核質 • 細胞質基質 生物学的プロセス • regulation of gene expression by genetic imprinting • regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • negative regulation of gene expression, epigenetic • 脊髄発生 • positive regulation of histone H3-K27 methylation • ヒストンのメチル化 • negative regulation of transcription, DNA-templated • regulation of adaxial/abaxial pattern formation • histone H3-K27 methylation • cellular response to leukemia inhibitory factor • negative regulation of G0 to G1 transition • chromatin organization 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
種	ヒト	マウス
Entrez	8726	13626
Ensembl	ENSG00000074266	ENSMUSG00000030619
UniProt	O75530	Q921E6
RefSeq (mRNA)	NM_001308007 NM_003797 NM_152991 NM_001330334	NM_021876
RefSeq (タンパク質)	NP_001294936 NP_001317263 NP_003788	NP_068676
場所 (UCSC)	Chr 11: 86.24 – 86.28 Mb	Chr 11: 89.6 – 89.63 Mb
PubMed検索
ウィキデータ
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機能

EEDは、ポリコーム群タンパク質（PcG）の一員である。PcGファミリーのメンバーは多量体タンパク質複合体を形成し、複数の細胞世代にわたって持続する転写抑制状態の維持に関与している。このタンパク質は、EZH2、β7インテグリンの細胞質テール、HIV-1のMAタンパク質、そしてヒストン脱アセチル化酵素と相互作用する。このタンパク質は、ヒストンの脱アセチル化を介して遺伝子活性の抑制を媒介し、またインテグリンの機能の特異的調節因子として機能する可能性もある。

臨床的意義

ヒトでは、ウィーバー症候群と類似した症状を示す患者にEED遺伝子のde novo変異が報告されている。

相互作用

EEDは次に挙げる因子と相互作用することが示されている。

• EZH2
• HDAC1
• HDAC2
• ITGB7
• PPP1R8
• TGS1

関連文献

• “Nef: "necessary and enforcing factor" in HIV infection”. Curr. HIV Res. 3 (1): 87–94. (2005). doi:10.2174/1570162052773013. PMID 15638726. 
• “HIV-1 integration: an interplay between HIV-1 integrase, cellular and viral proteins”. AIDS Rev 7 (1): 26–43. (2005). PMID 15875659. 
• “The Drosophila esc and E(z) proteins are direct partners in polycomb group-mediated repression”. Mol. Cell. Biol. 18 (5): 2825–34. (1998). doi:10.1128/mcb.18.5.2825. PMC 110661. PMID 9566901. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC110661/. 
• “Interaction of mouse polycomb-group (Pc-G) proteins Enx1 and Enx2 with Eed: indication for separate Pc-G complexes”. Mol. Cell. Biol. 18 (6): 3572–9. (1998). doi:10.1128/MCB.18.6.3572. PMC 108938. PMID 9584197. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC108938/. 
• “Characterization of interactions between the mammalian polycomb-group proteins Enx1/EZH2 and EED suggests the existence of different mammalian polycomb-group protein complexes”. Mol. Cell. Biol. 18 (6): 3586–95. (1998). doi:10.1128/mcb.18.6.3586. PMC 108940. PMID 9584199. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC108940/. 
• “Point mutations in the WD40 domain of Eed block its interaction with Ezh2”. Mol. Cell. Biol. 18 (10): 5634–42. (1998). doi:10.1128/MCB.18.10.5634. PMC 109149. PMID 9742080. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC109149/. 
• “HEED, the product of the human homolog of the murine eed gene, binds to the matrix protein of HIV-1”. J. Biol. Chem. 274 (3): 1635–45. (1999). doi:10.1074/jbc.274.3.1635. PMID 9880543. 
• “Transcriptional repression mediated by the human polycomb-group protein EED involves histone deacetylation”. Nat. Genet. 23 (4): 474–8. (1999). doi:10.1038/70602. PMID 10581039. 
• “The polycomb group protein EED interacts with YY1, and both proteins induce neural tissue in Xenopus embryos”. Mol. Cell. Biol. 21 (4): 1360–9. (2001). doi:10.1128/MCB.21.4.1360-1369.2001. PMC 99588. PMID 11158321. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC99588/. 
• “Histone methyltransferase activity associated with a human multiprotein complex containing the Enhancer of Zeste protein”. Genes Dev. 16 (22): 2893–905. (2002). doi:10.1101/gad.1035902. PMC 187479. PMID 12435631. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC187479/. 
• “The protein phosphatase-1 (PP1) regulator, nuclear inhibitor of PP1 (NIPP1), interacts with the polycomb group protein, embryonic ectoderm development (EED), and functions as a transcriptional repressor”. J. Biol. Chem. 278 (33): 30677–85. (2003). doi:10.1074/jbc.M302273200. PMID 12788942. 
• “Different isoforms of PRIP-interacting protein with methyltransferase domain/trimethylguanosine synthase localizes to the cytoplasm and nucleus”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 309 (1): 44–51. (2003). doi:10.1016/S0006-291X(03)01514-6. PMID 12943661. 
• “The human polycomb group EED protein interacts with the integrase of human immunodeficiency virus type 1”. J. Virol. 77 (23): 12507–22. (2003). doi:10.1128/JVI.77.23.12507-12522.2003. PMC 262565. PMID 14610174. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC262565/. 
• “HIV-1 Nef mimics an integrin receptor signal that recruits the polycomb group protein Eed to the plasma membrane”. Mol. Cell 13 (2): 179–90. (2004). doi:10.1016/S1097-2765(04)00004-8. PMID 14759364. 
• “SUZ12 is required for both the histone methyltransferase activity and the silencing function of the EED-EZH2 complex”. Mol. Cell 15 (1): 57–67. (2004). doi:10.1016/j.molcel.2004.06.020. PMID 15225548. 
• “Suz12 is essential for mouse development and for EZH2 histone methyltransferase activity”. EMBO J. 23 (20): 4061–71. (2004). doi:10.1038/sj.emboj.7600402. PMC 524339. PMID 15385962. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC524339/. 

外部リンク

• Overview of all the structural information available in the PDB for UniProt: O75530 (Polycomb protein EED) at the PDBe-KB.