2-C-メチル-D-エリトリトール 2,4-シクロ二リン酸シンターゼ
2-C-メチル-D-エリトリトール 2,4-シクロ二リン酸シンターゼ (2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase、EC 4.6.1.12)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。
| 2-C-メチル-D-エリトリトール 2,4-シクロ二リン酸シンターゼ | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 識別子 | |||||||||
| EC番号 | 4.6.1.12 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| IntEnz | IntEnz view | ||||||||
| BRENDA | BRENDA entry | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme view | ||||||||
| KEGG | KEGG entry | ||||||||
| MetaCyc | metabolic pathway | ||||||||
| PRIAM | profile | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum | ||||||||
| 遺伝子オントロジー | AmiGO / QuickGO | ||||||||
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- 2-ホスホ-4-(シチジン-5'-二リン酸)-2-C-メチル-D-エリトリトール 2-C-メチル-D-エリトリトール-1,4-シクロ二リン酸 + CMP
従って、この酵素の基質は2-ホスホ-4-(シチジン-5'-二リン酸)-2-C-メチル-D-エリトリトールのみ、生成物は2-C-メチル-D-エリトリトール-1,4-シクロ二リン酸とシチジル酸の2つである。
この酵素はリアーゼ、特にリン-酸素リアーゼに分類される。系統名は、2-ホスホ-4-(シチジン-5'-二リン酸)-2-C-メチル-D-エリトリトール CMPリアーゼ (環化; 2-C-メチル-D-エリトリトール-1,4-シクロ二リン酸形成)(2-phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol CMP-lyase (cyclizing; 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate-forming))である。他に、MECDP-synthase、2-phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol、CMP-lyase (cyclizing)等とも呼ばれる。
構造
編集2007年末時点で、20個の構造が解明されている。蛋白質構造データバンクのコードは、1GX1、1H47、1H48、1IV1、1IV2、1IV3、1IV4、1T0A、1U3L、1U3P、1U40、1U43、1VH8、1VHA、1W55、1W57、1YQN、2AMT、2GZL及び2PMPである。
出典
編集- Fellermeier M, Eisenreich W, Zenk MH, Bacher A, Rohdich F (2000). “Biosynthesis of terpenoids: YgbB protein converts 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate to 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97 (6): 2486–90. doi:10.1073/pnas.040554697. PMC 15955. PMID 10694574.
- Seto H (2000). “Studies on the nonmevalonate pathway: Formation of 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate from 2-phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol”. Tetrahedron Lett. 41 (18): 3395–3398. doi:10.1016/S0040-4039(00)00375-0.