複合タンパク質(ふくごうたんぱくしつ、英語: conjugated protein)は、タンパク質の分類の一つで、加水分解によりアミノ酸以外にも他の化合物を生成するタンパク質のことである。ムチン、ヘモグロビン、カゼインなどがそれに該当する。
複合タンパク質は、非アミノ酸部分における化学的な性質により以下の種類に分類される。
この項目は、生物学に関連した書きかけの項目です。この項目を加筆・訂正などしてくださる協力者を求めています(プロジェクト:生命科学/Portal:生物学)。