第16潜水艦戦隊(16-я Эскадра подводных лодок)は、ロシア海軍太平洋艦隊に所属する戦隊級(小艦隊と師団の間に位置する)部隊。原子力潜水艦を装備する2個師団から成る。カムチャツカのルイバチー港(ヴィリュチンスク市)に戦隊本部を置く。