門 (分類学)

生物ドメイン界門綱目科属種

門（もん、英: phylum, division、複数形: phyla、羅: phylum, divisio）は、生物分類のリンネ式階層分類における基本的分類階級のひとつであり、またその階級に属するタクソンのことである。生物全体はおよそ100の門に分類されているが、この数字は分類学者によって大きく異なる。界の下・綱の上に位置しており、門の下に亜門（あもん、英: subphylum, subdivision）を置く場合もある。

位置

門はリンネが『自然の体系』で用いた分類階級ではなく、19世紀以降に綱をさらにグループ化する階級として導入された。必要に応じて（界）・亜界・下界・上枝・枝・亜枝・下枝・上門・（門・亜門）・下門・上綱・（綱）などを適宜使う。

後生動物では慣例的に、基本的な体制が共通しているタクソンが門とされ、約30の門に分類されている。たとえば、ヒトは脊索動物門に属する。

→後生動物の門の完全なリストについては「動物#分類」を参照

呼称

従来、英語などでは門を、動物学では phylum と呼び、植物学では国際植物命名規約（現在の国際藻類・菌類・植物命名規約）に基づき division と呼んだ。東京規約（国際植物命名規約の1994年の版）から、植物学でも phylum と呼ぶことが認められたが、現在でも division と呼ぶことが多い。

植物学の命名規約では1905年のウィーン規則以来divisionと呼んでいたが、藻類や菌類は原生動物と密接な関係があり、同じ階級に対して複数の用語が使われる煩わしさが指摘されていた。これを動物学で用いられているphylumに統一しようという提案は1974年にはじめてなされ、以降数回にわたって国際植物学会議における議題に上がっているが、様々な理由から可決されなかった。その1つには、過去にphylumとdivisionを同時に別の階級として利用した例があり、その扱いが考慮されていないというものがあった。またphylumは系統関係を強く示唆する語であって階級の名としては相応しくない、わざわざ動物学の不適切な用語に合わせる必要はないというものもあった^[1]^[2]。最終的に1993年の東京会議で、phylumとdivisionを等価なものとしてどちらも利用可能とし、仮に同時に別の階級として利用した場合には既存の規定通り正式発表されたと見なさない、とする変更が可決された^[3]^[4]。

phylum の語源はギリシア語の phylai で、原義は古代ギリシアの都市国家において血縁に基づき決められた投票グループのことである。ヘッケルが Generelle Morphologie der Organismen (1866) で導入した語であるが、概念としてはキュヴィエが用いた embranchement「分岐」と同義である。division の原義は「分ける」である。

命名法

門・亜門に対する命名法は一般にあまり強く規制されていない。国際藻類・菌類・植物命名規約、国際動物命名規約、国際原核生物命名規約のいずれでも、優先権を必ずしも守る必要がなく、タイプの名前を元にして作る必要もない。国際藻類・菌類・植物命名規約では、タイプの名前を元にして命名する場合には属名を元にして語尾を統一することが規定されているが、説明的な名前の場合にはその必要はない。なお、植物学では上門・下門はほとんど使われない。国際動物命名規約や国際原核生物命名規約にはそもそも門以上の階級に対する規定はないため統一語尾は存在しないが、慣例的にほとんどは -a で終わり、とくに動物は -zoa、細菌は -bacteria、古細菌は -archaeota が多い。国際原核生物命名規約では、2015年と2018年に門に対する規定の提案が提出されており^[5]、タイプ綱の語幹に語尾 -otaを付ける（綱名が -bacteria の場合は -bacteriota となる）ことが提案されている^[6]。

ウイルスには現在のところ門・亜門などの階級は存在しない。

門名の語尾
階級	陸上植物	藻類	菌類	細菌	動物
門	-phyta		-mycota
亜門	-phytina		-mycotina

一覧

真核生物ドメイン

真核生物ドメイン（Domain Eukarya）の門（phylum）一覧。

動物界

動物界（Kingdom Animalia）の門（phylum）一覧。


上位分類（亜界・上門）				門	胚発生等		特徴	代表例	種類
				海綿動物門（Porifera）	無胚葉	器官が明確には分化せず	内壁に多くの穴（孔）を持つ	カイメン、カイロウドウケツ	5000以上
				平板動物門（Placozoa）	無胚葉	器官が明確には分化せず	平板	センモウヒラムシ	1
真正後生動物				刺胞動物門（Cnidaria）	2胚葉	消化管は出入口が同じ	刺胞（cnidocyte）を持つ	クラゲ、サンゴ	約11000
				有櫛動物門（Ctenophora）	2胚葉		8列の櫛板（櫛板列）を持つ	クシクラゲ	約100
	左右相称動物	旧口動物	冠輪動物	扁形動物門（Platyhelminthes）	3胚葉		扁形	プラナリア、キュウチュウ、サナダムシ	約25000
				無腸動物門（Acoelomorpha）		器官退化?	無腸	ナイカイムチョウウズムシ	約400
				菱形動物門（Rhombozoa）			1つの軸細胞が繊毛細胞に囲まれている	ニハイチュウ	75
				直泳動物門（Orthonectida）			生殖細胞などを繊毛が囲んでいる	キリオキンクタ	約20
				紐形動物門（Nemertea）		消化管は出口と入口を持つ	紐状	ヒモムシ	約1200
				顎口動物門（Gnathostomulida）			クチクラ性の固い顎	ハプログナチア	約100
				腹毛動物門（Gastrotricha）			腹部の2本の粘着腺	イタチムシ、オビムシ	約700
				輪形動物門（Rotifera）			ゴブレット（杯）型の胴体、触手冠	ワムシ	約2000
				内肛動物門（Entoprocta）			触手冠の内側にある肛門	スズコケムシ	約150
				外肛動物門（Bryozoa）			触手冠、群体、多形化	チゴケムシ、コケムシ	約8000
				箒虫動物門（Phoronida）			口の周囲の触手冠、U字型の消化管	ホウキムシ	11
				腕足動物門（Brachiopoda）			肉茎と触手冠	ホオズキガイ、シャミセンガイ	約300
				星口動物門（Sipuncula）			陥入吻	ホシムシ	約250
				ユムシ動物門（Echiura）			スプーン状の口吻	ユムシ	約140
				毛顎動物門（Chaetognatha）			クチクラ質で細長い	ヤムシ	約100
				有輪動物門（Cycliophora）			袋状の胴体と、繊毛で覆われた円形の口（繊毛冠）	シンビオン	3以上
				微顎動物門（Micrognathozoa）			アコーディオン状の胴体	リムノグナシア	1
				環形動物門（Annelida）			環状の体節	ミミズ、ゴカイ	17000以上
				軟体動物門（Mollusca）			筋肉質の軟体と外套膜	貝類、イカ、タコ	約112000
			脱皮動物	線形動物門（Nematoda）			線形	回虫	80000以上
				類線形動物門（Nematomorpha）			線形動物に似た生態	ハリガネムシ	約320
				鰓曳動物門（Priapulida）			円筒状	エラヒキムシ	16
				胴甲動物門（Loricifera）			胴部の殻、傘のような付属肢	コウラムシ	約120
				動吻動物門（Kinorhyncha）			計11の体節	トゲカワ	約150
				緩歩動物門（Tardigrada）			頭部1つと胴体4つの体節	クマムシ	1000以上
				有爪動物門（Onychophora）			キチン（クチクラ）質の爪	カギムシ	約200
				節足動物門（Arthropoda）			キチン（クチクラ）質の外骨格による体節	昆虫類、甲殻類	1134000以上
		新口動物		珍渦虫動物門 (Xenoturbellida)			繊毛に覆われた後口動物	チンウズムシ	6
				棘皮動物門（Echinodermata）			棘皮を持つ	ウニ、ヒトデ、クモヒトデ、ナマコ	約7000
				半索動物門（Hemichordata）			口盲管（半索）を持つ	ギボシムシ	約100
				脊索動物門（Chordata）			脊索・脊椎を持つ	ホヤ、脊椎動物	100000以上

植物界

植物界（Kingdom Plantae）の門（division）一覧。

上位分類（亜界）		門	綱	門（従来版）
アーケプラスチダ Archae- plastida	紅色植物門 Rhodophyta		真正紅藻綱 Florideophyceaeなど
	紅色植物門 Rhodophyta		イデユコゴメ綱 Cyanidiophyceae
	灰色植物門 Glaucophyta
	緑色植物亜界 Viridi- plantae	緑藻植物門 Chlorophyta	緑藻綱 Chlorophyceae
			トレボウクシア藻綱 Trebouxiophyceae
			アオサ藻綱 Ulvophyceae
			プラシノ藻綱　（ペディノ藻、クロロデンドロン藻、ミクロモナス藻）
		ストレプト植物門 Streptophyta	車軸藻綱 Charophyceae、接合藻綱Zygnematophyceae、等
			陸上植物（有胚植物） Embryophyta	ゼニゴケ植物門（苔類） Marchantiophyta
				マゴケ植物門（蘚類）Bryophyta
				ツノゴケ植物門Anthocerotophyta
				維管束植物 Tracheo- phyta	ヒカゲノカズラ植物門 Lycopodiophyta
					真葉植物 Euphyllo- phyta	シダ植物門 Pteridophyta
						種子植物 Spermato- phyta	裸子植物門 Gymnospermae
						種子植物 Spermato- phyta	被子植物門 Angiospermae

菌界

菌界（Kingdom Fungi）の門（phylum）一覧。

原生生物界

原生生物界（Kingdom Protista）の門（phylum）一覧。

古細菌（アーキア）ドメイン

古細菌（アーキア）ドメイン（Domain Archaea）の門（phylum）一覧。


上位分類（界・上門）	門	細胞機構等		特徴	代表例	種類
ユーリ古細菌界 Euryarchaeota	ユーリ古細菌門 Euryarchaeota	Zリングによる細胞分裂	DNAPolD,BI	9綱を含み多様	Pyrococcus furiosus, Halobacterium salinarum, Methanobrevibacter smithii, Thermoplasma acidophilum	539
DPANN群またはユーリ古細菌界	ナノ古細菌門 Nanoarchaeota	Zリングによる細胞分裂		寄生性	Nanobdella aerobiophila	1
プロテオ古細菌界 Proteoarchaeota	クレン古細菌門 Crenarchaeota	ESCRT複合体による細胞分裂	DNAPolBI,BII、RNApolG	大半が好熱菌	Sulfolobus acidocaldarius, Pyrobaculum islandicum	69
プロテオ古細菌界 Proteoarchaeota	タウム古細菌門 Thaumarchaeota	ESCRT複合体による細胞分裂	DNAPolBII,D、TopIB	中温性が多い。大半は亜硝酸菌で残りも好気性菌が占める。	Nitrososphaera viennensis, Nitrosopumilus maritimus	6

他に記載種を含まないものとして10門以上

細菌（バクテリア）ドメイン

細菌（バクテリア）ドメイン（Domain Bacteria）の門（phylum）一覧。


上位分類		門	グラム染色		特徴	代表例	種類
真正細菌 Bacteria	FCB	フィブロバクター門 Fibrobacteres	外膜あり	グラム陰性			6
		クロロビウム門 Chlorobi				緑色硫黄細菌	17
		バクテロイデス門 Bacteroides					2344
		ゲンマティモナス門 Gemmatimonadetes					4
	PVC	プランクトミケス門 Planctomycetes			核膜様構造。ペプチドグリカン欠損。TtsZ欠損		106
		ウェルコミクロビウム門 Verrucomicrobia			核膜様構造		61
		クラミジア門 Chlamydiae			ペプチドグリカン欠損。FtsZ欠損。ATP合成酵素を欠損し、寄生性。	クラミジア・トラコマチス	15
		レンティスファエラ門 Lentisphaerae			核膜様構造		6
		アキドバクテリウム門 Acidobacteria					62
		アクウィフェクス門 Aquificae			16S rRNA系統解析において、真正細菌の中でも早くに分岐したとされる。好気性菌が多い。好熱性は真正細菌の中で最も高い。		30
		カルディセリクム門 Caldiserica					3
		クリシオゲネス門 Chrysiogenetes					4
		デフェリバクター門 Deferribacteres					12
		ディクチオグロムス門 Dictyoglomi					2
		エルシミクロビウム門 Elusimicrobia					2
		フソバクテリウム門 Fusobacteria					48
		ニトロスピラ門 Nitrospira					10
		プロテオバクテリア門 Proteobacteria				大腸菌	7068
		スピロヘータ門 Spirochetes			細いらせん状、鞭毛が菌体内に存在する特徴がある。	梅毒トレポネーマ	194
		シネルギステス門 Synergistetes					28
		サーモデスルフォバクテリウム門 Thermodesulfobacteria					12
		テルモトガ門 Thermotogae			16S rRNA系統解析において、真正細菌の中でも早くに分岐したとされる。嫌気性。好熱性が高い。	Thermotoga maritima	52
	テッラバクテリア	シアノバクテリア門 Cyanobacteria			酸素発生型光合成細菌。一部の種はシストを形成する。	ユレモ	2654 ※ICN準拠他はICNB準拠 ※2008年現在
		アルマティモナス門 Armatimonadetes			好気化学合成従属栄養の小群。		4
		デイノコックス・テルムス門 Deinococcus-Thermus		系統による	放射性耐性菌や好熱菌を含む。	Deinococcus radiodurans	127
		クロロフレクサス門 Chloroflexi	外膜無し	系統による	リポ多糖を含む外膜を欠く。一部は出芽胞子を形成する。	緑色非硫黄細菌	54
		マイコプラズマ門 Mycoplasmatota		グラム陰性	細胞壁を欠く。		223
		放線菌門 Actinobacteria		グラム陽性	多くはいわゆる放線菌で、好気環境に生息し気菌糸と分節胞子を形成する。GC含量が55%以上のものが多い。	ビフィズス菌、結核菌	4107
		フィルミクテス門 Firmicutes		グラム陽性	内性胞子を形成する種が多い。GC含量が放線菌に比べ低く、25～55%のものが多い。	枯草菌	3251

参考文献

^ Thomas & Raven (1986). “(258) Proposal to Substitute the Term "Phylum" for "Division" in Art. 3.1 and Elsewhere in the Code”. Taxon 35 (4): 842-843. doi:10.2307/1221673.
^ Greuter et al. (1989). “Report on Botanical Nomenclature: Berlin 1987. XIV International Botanical Congress, Berlin: Nomenclature Section, 20 to 24 Juli 1987”. Englera 9: 34-36. doi:10.2307/3776740.
^ Hawksworth, D.L. (1993). “(245-259) Fifteen Miscellaneous Proposals Towards the Evolution of a "Code" Appropriate to the Needs of the 21st Century”. Taxon 42 (1): 156-162. doi:10.2307/1223328.
^ Greuter et al. (1994). “Report on Botanical Nomenclature: Yokohama 1993. XV International Botanical Congress, Tokyo: Nomenclature Section, 23 to 27 August 1993”. Englera 14: 38-39. doi:10.2307/3776762.
^ Oren et al. (2015). “Proposal to include the rank of phylum in the International Code of Nomenclature of Prokaryotes”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 65 (11): 4284–4287. doi:10.1099/ijsem.0.000664.
^ Whitman et al. (2018). “Proposal of the suffix –ota to denote phyla. Addendum to ‘Proposal to include the rank of phylum in the International Code of Nomenclature of Prokaryotes’”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 68 (3): 967–969. doi:10.1099/ijsem.0.002593.