1880年(明治13年)に私立奨進医会(1927年に日本醫史學會(日本医史学会)と改称)により発刊され、以降1940年(昭和15年)の1286号まで刊行された[1]。創刊時の出版者は中外医事新報社の原田貞吉である。
後継誌は『日本醫史學雜誌』で、通巻1287号(1941年1月)から1334号(1944年12月)ののち、巻名体系を変更して通巻1335号を5巻1号(1954年1月)とした[1]。
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