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リピドーム

リピドーム(lipidome)は、細胞中の脂質の総体である。脂質は、タンパク質、糖、核酸とともに、生体の4つの主要成分の1つである。リピドームという言葉は、脂質（リピッド）とオーミクスを合わせた言葉であり、この研究分野をリピドミクスという[2]。質量分析法とバイオインフォマティクス等を用いて研究される[3][4]。細胞のリピドームは、細胞膜リピドームと媒介リピドームに細分される[5]。

出芽酵母の成長の各段階での定量的リピドーム[1]

最初に発表された細胞のリピドームは、2010年、マウスのマクロファージのものであった[6]。出芽酵母のリピドームは、約95%が同定された[7]。ヒトのリピドームは、進行中である[2][6]。研究により、個人のリピドームにより、食品中の脂質と関連する癌、特に乳癌のリスクを示せることが明らかとなった[8][9]。

関連項目

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出典

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  1. ^ Klose, C; Surma, MA.; Gerl, MJ.; Meyenhofer, F; Shevchenko, A; Simons, K (April 2012). “Flexibility of a Eukaryotic Lipidome – Insights from Yeast Lipidomics”. PLoS ONE 7 (4): e35063. doi:10.1371/journal.pone.0035063. PMC 3329542. PMID 22529973. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3329542/. 
  2. ^ a b Quehenberger O, Armando AM, Brown AH, et al. (November 2010). “Lipidomics reveals a remarkable diversity of lipids in human plasma”. J. Lipid Res. 51 (11): 3299–305. doi:10.1194/jlr.M009449. PMC 2952570. PMID 20671299. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2952570/ 2011年5月7日閲覧。. 
  3. ^ Subramaniam S, Fahy E, Gupta S, Sud M, Byrnes R.W, Cotter D, Dinasarapu A.R and Maurya M.R (2011). “Bioinformatics and Systems Biology of the Lipidome”. Chemical Reviews 111 (10): 6452–6490. doi:10.1021/cr200295k. PMC 3383319. PMID 21939287. http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/cr200295k. 
  4. ^ Seppänen-Laakso T, Oresic M (March 2009). “How to study lipidomes”. J. Mol. Endocrinol. 42 (3): 185–90. doi:10.1677/JME-08-0150. PMID 19060177. 
  5. ^ “Lipidomics”. BioSoft. 7 May 2011閲覧。
  6. ^ a b “First Functioning 'Lipidome' of Mouse Macrophage Described”. ScienceDaily. 7 May 2011閲覧。
  7. ^ Ejsing CS, Sampaio JL, Surendranath V, et al. (February 2009). “Global analysis of the yeast lipidome by quantitative shotgun mass spectrometry”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106 (7): 2136–41. doi:10.1073/pnas.0811700106. PMC 2650121. PMID 19174513. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2650121/ 2011年5月7日閲覧。. 
  8. ^ Bougnoux P, Hajjaji N, Couet C (2008). “The lipidome as a composite biomarker of the modifiable part of the risk of breast cancer”. Prostaglandins Leukot. Essent. Fatty Acids 79 (3–5): 93–6. doi:10.1016/j.plefa.2008.09.004. PMID 18930643. 
  9. ^ Bougnoux P, Giraudeau B, Couet C (March 2006). “Diet, cancer, and the lipidome”. Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev. 15 (3): 416–21. doi:10.1158/1055-9965.EPI-05-0546. PMC 2755770. PMID 16537692. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2755770/ 2011年5月7日閲覧。. 

関連文献

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  • Mutch DM, Fauconnot L, Grigorov M, Fay LB (2006). “Putting the 'Ome' in lipid metabolism”. Biotechnol Annu Rev 12: 67–84. doi:10.1016/S1387-2656(06)12003-7. PMID 17045192. 
  • van der Meer-Janssen YP, van Galen J, Batenburg JJ, Helms JB (January 2010). “Lipids in host-pathogen interactions: pathogens exploit the complexity of the host cell lipidome”. Prog. Lipid Res. 49 (1): 1–26. doi:10.1016/j.plipres.2009.07.003. PMID 19638285. 
  • Gaspar ML, Aregullin MA, Jesch SA, Nunez LR, Villa-García M, Henry SA (March 2007). “The emergence of yeast lipidomics”. Biochim. Biophys. Acta 1771 (3): 241–54. doi:10.1016/j.bbalip.2006.06.011. PMID 16920401. 

外部リンク

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