ハプログループR (mtDNA)
ハプログループR (mtDNA) はユーラシアを中心に広く分布するミトコンドリアDNAハプログループである。このグループは約70,000年前の出アフリカ後の移住に関連している[3]。ハプログループNを親系統に持ち、B、F、R0、JTなどの子系統を生み出した。
| R 系統 | |
|---|---|
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| 系統祖 | {{{major-haplo}}} |
| 発生時期 | 66.8±14.2 kya [1] |
| 発生地（推定） | 西南アジア？ |
| 親階層 | N |
| 分岐指標 | 12705, 16223[2] |
| 子階層 | R0, R1, R1b, R2'JT, R3, R5, R6'7, R8, R9, R11'B, R12'21, R14, R22, R23, R30, R31, P, U |
起源と分布
編集Soares et al. (2009)はハプログループRの誕生を66.8±14.2 kya (95% CI)[1]（およそ80,000 - 50,000年前、おそらく65,000年前）と推定した。
このグループの分布は、現生人類の東アフリカから西、南、東南アジアへの移住と一致する[4]。 およそ70,000年から60,000年前の間に、ハプログループM、N、およびRの初期の下位系統が出現したと考えられる[5]。特に南アジアの先住民で幅広い多様性と古さを示しており、インド西部と南部のトライブとカーストは他の地域よりも多様性が高く、おそらく彼らの自生の地位を示唆している[6]。シベリアのウスト・イシム人はハプログループR*に属している[7][8]。
ハプログループRとその子孫は、オーストラリア、南北アメリカ、東南アジア、南アジア、中央アジア、西アジア、東アジア、ヨーロッパ、北アフリカ、アフリカの角に分布しているが、パラグループR*は、ソコトラ（1.2％）、北東アフリカ（1.5％）、中東（0.8％）、近東（0.8％）、アラビア半島（0.3％）に見られる[9]ため、このあたりが発祥地と考えられる。
| ミトコンドリア・イブ (L) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| L0 | L1 | L5 | L2 | L6 | L4 | L3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| M7 | M8 | M9 | D | G | Q | N1 | N2 | N9 | A | O | S | X | R | ||||||||||||||||||||||||||
| M7a | C | Z | E | I | W | Y | R0 | R9 | B | JT | P | U | |||||||||||||||||||||||||||
| HV | F | J | T | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
脚注
編集- ^ a b Soares, Pedro; Ermini, Luca; Thomson, Noel; Mormina, Maru; Rito, Teresa; Röhl, Arne; Salas, Antonio; Oppenheimer, Stephen et al. (2009). “Correcting for Purifying Selection: An Improved Human Mitochondrial Molecular Clock”. The American Journal of Human Genetics 84 (6): 740–59. doi:10.1016/j.ajhg.2009.05.001. PMC 2694979. PMID 19500773.
- ^ Van Oven, Mannis; Kayser, Manfred (2009). “Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation”. Human Mutation 30 (2): E386–94. doi:10.1002/humu.20921. PMID 18853457.
- ^ Larruga, Jose M (23 May 2017). “Carriers of mitochondrial DNA macrohaplogroup R colonized Eurasia and Australasia from a southeast Asia core area”. BMC Evolutionary Biology 17 (1): 115. doi:10.1186/s12862-017-0964-5. PMC 5442693. PMID 28535779.
- ^ Karmin, Monika (2005). Human mitochondrial DNA haplogroup R in India: dissecting the phylogenetic tree of South Asian-specific lineages (M.Sc. Thesis). University of Tartu. hdl:10062/567. OCLC 692161090[要ページ番号]
- ^ Palanichamy, Malliya Gounder; Sun, Chang; Agrawal, Suraksha; Bandelt, Hans-Jürgen; Kong, Qing-Peng; Khan, Faisal; Wang, Cheng-Ye; Chaudhuri, Tapas Kumar et al. (2004). “Phylogeny of Mitochondrial DNA Macrohaplogroup N in India, Based on Complete Sequencing: Implications for the Peopling of South Asia”. The American Journal of Human Genetics 75 (6): 966–78. doi:10.1086/425871. PMC 1182158. PMID 15467980.
- ^ Maji, Suvendu; Krithika, S.; Vasul, T.S. (2008). “Distribution of Mitochondrial DNA Macrohaplogroup N in India with Special Reference to Haplogroup R and its Sub-Haplogroup U”. International Journal of Human Genetics 8 (1–2): 85–96. doi:10.1080/09723757.2008.11886022.
- ^ Marrero, Patricia; Abu-Amero, Khaled K; Larruga, Jose M; Cabrera, Vicente M (2016). “Carriers of human mitochondrial DNA macrohaplogroup M colonized India from southeastern Asia”. BMC Evolutionary Biology 16 (1): 246. doi:10.1186/s12862-016-0816-8. PMC 5105315. PMID 27832758.
- ^ Larruga, Jose M; Marrero, Patricia; Abu-Amero, Khaled K; Golubenko, Maria V; Cabrera, Vicente M (2017). “Carriers of mitochondrial DNA macrohaplogroup R colonized Eurasia and Australasia from a southeast Asia core area”. BMC Evolutionary Biology 17 (1): 115. doi:10.1186/s12862-017-0964-5. PMC 5442693. PMID 28535779.
- ^ Černý, Viktor (2009). “Out of Arabia—the settlement of island Soqotra as revealed by mitochondrial and Y chromosome genetic diversity”. American Journal of Physical Anthropology 138 (4): 439–447. doi:10.1002/ajpa.20960. PMID 19012329. オリジナルの6 October 2016時点におけるアーカイブ。 13 June 2016閲覧。.
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