クロモドメイン
クロモドメイン（英: chromodomain、chromatin organization modifier[2]）は、クロマチンのリモデリングや操作に関係するタンパク質に広く存在する、約40–50アミノ酸残基からなるタンパク質ドメインである。このドメインは植物と動物の双方で高度に保存されており、また多くのゲノムにおいて多数の異なる遺伝子中にコードされている。クロモドメイン含有遺伝子の一部には、クロモドメインを完全に省いた複数の選択的スプライシングアイソフォームが存在するものもある[3]。哺乳類では、クロモドメインを持つタンパク質は、クロマチンリモデリングやヘテロクロマチン領域の形成と関係した遺伝子調節を担っている[4]。クロモドメインを持つタンパク質はメチル化されたヒストンに結合し[5][6]、RNA誘導転写サイレンシング（RITS）複合体中にも存在するようである[7]。クロモドメインはヒストン修飾に関与する因子の中で高度に保存されており、クロマチンタンパク質の表面に存在するメチル化リジン残基に結合して転写を調節する機能を果たす[8]。
| Chromodomain | |||||||||
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 Polycombのクロモドメインの構造[1] | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| 略号 | Chromodomain | ||||||||
| Pfam | PF00385 | ||||||||
| InterPro | IPR000953 | ||||||||
| SMART | SM00298 | ||||||||
| PROSITE | PS50013 | ||||||||
| SCOP | 1pfb | ||||||||
| SUPERFAMILY | 1pfb | ||||||||
| CDD | cd00024 | ||||||||
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出典
編集- ^ “Structural basis for specific binding of Polycomb chromodomain to histone H3 methylated at Lys 27”. Genes Dev. 17 (15): 1823–8. (August 2003). doi:10.1101/gad.269603. PMC 196225. PMID 12897052.
- ^ “Analysis of the functional role of the Polycomb chromo domain in Drosophila melanogaster”. Genes Dev. 6 (7): 1241–1254. (July 1992). doi:10.1101/gad.6.7.1241. PMID 1628830.
- ^ “Identification and Analysis of Chromodomain-Containing Proteins Encoded in the Mouse Transcriptome”. Genome Res 13 (6B): 1416–1429. (2003). doi:10.1101/gr.1015703. PMC 403676. PMID 12819141.
- ^ “Mammalian chromodomain proteins: their role in genome organisation and expression”. BioEssays 22 (2): 124–37. (2000). doi:10.1002/(SICI)1521-1878(200002)22:2<124::AID-BIES4>3.0.CO;2-E. PMID 10655032.
- ^ “Structure of the HP1 chromodomain bound to histone H3 methylated at lysine 9”. Nature 416 (6876): 103–7. (2002). doi:10.1038/nature722. PMID 11882902.
- ^ “Structure of HP1 chromodomain bound to a lysine 9-methylated histone H3 tail”. Science 295 (5562): 2080–3. (2002). doi:10.1126/science.1069473. PMID 11859155.
- ^ “RNAi-Mediated Targeting of Heterochromatin by the RITS Complex”. Science 303 (5658): 672–6. (2004). doi:10.1126/science.1093686. PMC 3244756. PMID 14704433.
- ^ “Structure and mechanisms of lysine methylation recognition by the chromodomain in gene transcription”. Biochemistry 50 (12): 1966–80. (March 2011). doi:10.1021/bi101885m. PMC 3062707. PMID 21288002.
関連項目
編集外部リンク
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